De pest veroorzaakte geen bijzondere problemen voor Isaac Newton persoonlijk.

Isaac Newton werd geboren op eerste kerstdag 1642 tijdens een periode van burgerlijke onrust in Engeland, bekend als de Engelse Burgeroorlog. De grote plaag van Londen, een van de dodelijkste pandemieën in Groot-Brittannië, vond plaats in 1665-1666, toen Newton 23-24 jaar oud was. Gedurende deze periode sloot de Universiteit van Cambridge twee jaar lang, waardoor Newton gedwongen werd terug te keren naar zijn huis in Woolsthorpe Manor, Lincolnshire.

Newtons tijd in Woolsthorpe Manor bleek een zeer productieve periode te zijn, bekend als zijn "annus mirabilis" of "jaar van wonderen". Afgezonderd van de afleidingen van het universitaire leven, boekte Newton belangrijke doorbraken in de wiskunde, optica en natuurkunde, waaronder de ontwikkeling van calculus, zijn werk over de wet van universele zwaartekracht en zijn theorie van optica en kleur.

Hoewel de pest zeker gevolgen heeft gehad voor Engeland en de Universiteit van Cambridge, zijn er geen aanwijzingen dat Isaac Newton er direct negatief door werd getroffen. In plaats daarvan bood het hem de kans om zich op zijn studie te concentreren en grote intellectuele prestaties te bereiken.