Ademhalingssysteem:

* Longen

* Luchtwegen (bronchiën, bronchiolen)

Neurologisch systeem:

* Brein

* Meninges (beschermende bedekking van de hersenen en het ruggenmerg)

Cardiovasculair systeem:

* Hart

* Bloedvaten

Spierstelsel:

* Spieren

* Gewrichten

Maag-darmstelsel:

* Slokdarm

* Maag

* Ingewanden

Urogenitale systeem:

* Nieren

* Blaas

* Voortplantingsorganen

Huid:

* Kan huiduitslag veroorzaken

Ogen:

* Conjunctivitis (pinkeye)

In ernstige gevallen kan het H1N1-virus leiden tot levensbedreigende complicaties zoals longontsteking, acuut ademnoodsyndroom (ARDS), sepsis en multi-orgaanfalen.