Het influenza B-virus moet de luchtwegen bereiken om te kunnen overleven. Het ademhalingssysteem is de belangrijkste infectieplaats voor influenzavirussen, waaronder influenza B. Het virus komt het lichaam binnen via de neus of mond en reist door de luchtwegen, waar het de cellen van de neus, keel en longen infecteert. Het virus vermenigvuldigt zich in deze cellen en veroorzaakt griepsymptomen, zoals koorts, hoesten, keelpijn en loopneus.