Nee, alcoholvrije handdesinfectiemiddelen beschermen niet tegen het varkensvirus, ook wel bekend als het H1N1-virus, of enige andere virale infectie. Handdesinfecterende middelen op alcoholbasis worden aanbevolen voor effectieve bescherming tegen virussen, omdat alcohol de buitenste laag ervan kan oplossen en deze inactief kan maken. Volgens de Centers for Disease Control and Prevention (CDC) zijn handdesinfecterende middelen op alcoholbasis met een alcoholgehalte van ten minste 60% noodzakelijk voor effectieve handhygiëne.