Bariumcarbonaat is giftig vanwege de hoge oplosbaarheid in water, waardoor het gemakkelijk door het lichaam wordt opgenomen.

Eenmaal geabsorbeerd kan barium de normale functie van cellen verstoren door calciumionen van hun bindingsplaatsen te verdringen. Dit kan leiden tot een verscheidenheid aan gezondheidsproblemen, waaronder spierzwakte, verlamming en zelfs de dood.

Bariumsulfaat is daarentegen relatief onoplosbaar in water en wordt daarom niet gemakkelijk door het lichaam opgenomen.

Als gevolg hiervan is bariumsulfaat veel minder giftig dan bariumcarbonaat. Bariumsulfaat wordt zelfs vaak gebruikt als radiocontrastmiddel bij medische beeldvormingsprocedures, vanwege het vermogen ervan om röntgenstralen te blokkeren en een duidelijk beeld van de inwendige organen te geven.