Blauwe marlijn is veilig om te eten en bevat doorgaans geen gifstoffen die gevaarlijk zijn voor de mens door consumptie. Bepaalde omstandigheden kunnen echter leiden tot gevallen van ciguatera-visvergiftiging bij het consumeren van blauwe marlijn als gevolg van de ophoping van natuurlijk voorkomende gifstoffen door het consumeren van andere kleinere vissen. Daarom zijn het begrijpen van de voedselveiligheidsrichtlijnen en het verkrijgen van blauwe marlijn uit gerenommeerde bronnen van cruciaal belang om potentiële risico's te voorkomen.