Het syndroom van Sjögren en lupus zijn beide auto-immuunziekten, maar het is niet dezelfde ziekte. Lupus is een systemische auto-immuunziekte die veel verschillende delen van het lichaam kan aantasten, waaronder de huid, gewrichten, nieren, longen en het hart. Het syndroom van Sjögren is een auto-immuunziekte die voornamelijk de exocriene klieren aantast, die speeksel en tranen produceren.