Er is geen remedie voor koortsblaasjes, maar er zijn verschillende manieren om ze te behandelen om de pijn en het ongemak te verminderen. Enkele voorbeelden zijn:plaatselijke antivirale medicijnen, orale antivirale middelen zoals aciclovir, famciclovir of valaciclovir, natuurlijke remedies zoals het aanbrengen van ijs, kokosolie of tea tree olie, en pijnstillers zoals ibuprofen of paracetamol.