Een langetermijneffect dat verband houdt met lagere oestrogeenspiegels is het verhoogde risico op het ontwikkelen van osteoporose, een aandoening die botten verzwakt en de kans groter maakt dat ze breken. Het is bekend dat oestrogeen helpt de botdichtheid en sterkte te behouden. Naarmate de oestrogeenspiegels tijdens de menopauze afnemen, kunnen vrouwen verlies van botmassa ervaren, wat leidt tot een verhoogd risico op fracturen en botverlies.