De symptomen van een hersencyste kunnen variëren, afhankelijk van de grootte, locatie en het type cyste. Enkele veel voorkomende symptomen kunnen zijn:
Hoofdpijn
Aanvallen
Misselijkheid en braken
Zusproblemen
Gehoorproblemen
Balansproblemen
Zwakte of gevoelloosheid aan één kant van het lichaam
Verwarring
Geheugenverlies
Moeite met spreken of spraak verstaan
In sommige gevallen veroorzaakt een hersencyste geen symptomen en kan deze per ongeluk ontdekt worden tijdens een MRI- of CT-scan van de hersenen.