Endometriumbiopten worden gewoonlijk uitgevoerd tijdens de eerste helft van de menstruatiecyclus (dag 7 tot 11), wanneer het baarmoederslijmvlies optimaal is voor het verzamelen van weefselmonsters en om interferentie met een mogelijke vroege zwangerschap te voorkomen. Endometriumbiopsie uitgevoerd tijdens hevige menstruatiebloedingen kan onvoldoende of minder nauwkeurige weefselmonsters opleveren vanwege de aanwezigheid van verstoord endometriumweefsel.

Wanneer hevige menstruatiebloedingen optreden, kan dit leiden tot vervorming of verdunning van het endometriumweefsel, waardoor de interpretatie van de biopsieresultaten lastig wordt. Hevig bloeden kan de procedure ook moeilijker maken en het risico op complicaties vergroten, zoals overmatig bloeden of infectie.

Daarom wordt het over het algemeen niet aanbevolen om een ​​endometriumbiopsie uit te voeren tijdens hevige bloedingen. In plaats daarvan wordt doorgaans geadviseerd om te wachten tot het bloeden is afgenomen en de procedure te plannen tijdens het eerste deel van de menstruatiecyclus, wanneer de endometriumvoering stabieler is. Dit zorgt voor een betrouwbaardere evaluatie van het endometriumweefsel en vermindert het risico op complicaties.