Bij vrouwen kunnen Wolffiaanse kanaalcysten in verband worden gebracht met verschillende andere afwijkingen, waaronder:

- Urogenitale sinusafwijkingen :Deze afwijkingen beïnvloeden de ontwikkeling van de vagina, baarmoeder en eileiders. Ze kunnen aandoeningen omvatten zoals vaginale agenese (afwezigheid van de vagina), baarmoederdidelphys (twee afzonderlijke baarmoeders) of bicornuate baarmoeder (baarmoeder met twee hoorns).

- Nierafwijkingen Cysten in de ductus Wolff kunnen in verband worden gebracht met nierafwijkingen, zoals een hoefijzernier (een enkele nier die aan de onderpolen is gefuseerd), een duplexnier (twee afzonderlijke nieren die een enkele urineleider delen) of hydronefrose (zwelling van de nier als gevolg van urineophoping).

- Skeletafwijkingen :Sommige vrouwtjes met cysten in de ductus Wolff kunnen skeletafwijkingen hebben, zoals scoliose (kromming van de wervelkolom) of hemivertebrae (gedeeltelijke of onvolledige vorming van wervels).

- Ovariële cysten :Cysten in de ductus Wolff kunnen soms in verband worden gebracht met cysten in de eierstokken, dit zijn met vocht gevulde zakjes die zich op de eierstokken ontwikkelen.

- Ongeperforeerd maagdenvlies :Een ongeperforeerd maagdenvlies is een aandoening waarbij het maagdenvlies, een dun membraan dat de opening van de vagina gedeeltelijk bedekt, volledig gesloten is. Dit kan de doorstroming van menstruatiebloed belemmeren en pijn en zwelling veroorzaken.

- Mülleriaanse agenesis :Mülleriaanse agenese verwijst naar de afwezigheid van mülleriaanse kanalen, de structuren die zich bij vrouwen ontwikkelen tot de eileiders, de baarmoeder en de baarmoederhals. Deze aandoening wordt vaak geassocieerd met de aanwezigheid van cysten in de ductus Wolffian.

Het is belangrijk op te merken dat niet alle vrouwtjes met cysten in het Wolffiaanse kanaal geassocieerde afwijkingen zullen hebben. De aanwezigheid van aanvullende afwijkingen kan afhangen van het individuele geval en de onderliggende oorzaak van de cyste.