Paraffineolie is ontvlambaar en heeft een laag vlampunt (doorgaans rond de 200 °C), dus autoclaveren wordt over het algemeen niet als veilig beschouwd. Paraffineoliedamp kan ook een explosieve atmosfeer creëren als deze in contact komt met een warmtebron. Bovendien kan paraffineolie reageren met zuurstof en peroxiden vormen, die schokgevoelig en potentieel explosief kunnen zijn.

Vanwege de ontvlambaarheid en andere gevaarlijke eigenschappen wordt het autoclaveren van paraffineolie niet aanbevolen en moet dit worden vermeden. In plaats daarvan moeten alternatieve methoden voor het steriliseren of desinfecteren van materialen of apparatuur worden gebruikt.