De pest had verschillende indirecte gevolgen die Byzantium kwetsbaarder maakten voor buitenlandse aanvallen:

Economische ontwrichting: De pest veroorzaakte grote verstoringen van de Byzantijnse economie, waaronder tekorten aan arbeidskrachten, handelsverstoringen en dalingen van de landbouwproductie.

Verzwakte verdediging: De pest leidde tot een tekort aan mankracht bij het leger, waardoor het voor hen moeilijk werd hun grenzen effectief te verdedigen. Bovendien eiste de pest het leven van ervaren militaire leiders, waardoor de strategische diepte van Byzantium werd verminderd.

Politieke instabiliteit: Verzwakt door economische ontwrichting en militaire verliezen als gevolg van de Ottomaanse en Venetiaanse aanvallen, waardoor de politieke instabiliteit binnen het rijk toenam, wat bijdroeg aan opvolgingsstrijd en interne conflicten die het verder verzwakten.

Deze gevolgen combineerden toegenomen externe bedreigingen en bevorderden het proces van Byzantijnse achteruitgang, waardoor het voor het rijk moeilijker werd om te herstellen naar zijn kracht vóór de tijd van Justinianus.