In het niermerg bevinden zich de verzamelkanalen, die verantwoordelijk zijn voor het concentreren van de urine. De verzamelkanalen zijn bekleed met gespecialiseerde cellen die water en opgeloste stoffen uit de urine kunnen transporteren, waardoor de nier een geconcentreerde urine kan produceren met een laag watergehalte. De medulla bevat ook de lussen van Henle, dit zijn lange, U-vormige structuren die helpen een concentratiegradiënt in de medulla te creëren. De lussen van Henle zijn verantwoordelijk voor het opnieuw absorberen van water en opgeloste stoffen uit de urine, waardoor de nier geconcentreerde urine kan produceren.