Het proces waarbij gifstoffen en ander afval actief door de nieren worden verwijderd, wordt "actieve tubulaire secretie" genoemd.

Terwijl toxinen en afvalstoffen het filtraat kunnen binnendringen door passieve diffusie, kunnen ze ook actief vanuit het bloedplasma in het filtraat worden uitgescheiden door bepaalde cellen in de niertubuli, vooral in de proximale ingewikkelde tubulus. Dit actieve uitscheidingsproces vereist energie en omvat specifieke transporteiwitten die zich aan de luminale zijde van de buisvormige cellen bevinden. Deze eiwitten binden zich aan de gifstoffen of afvalmoleculen en transporteren deze tegen een concentratiegradiënt in het filtraat.

Actieve tubulaire secretie speelt een belangrijke rol bij het elimineren van verschillende stoffen die niet effectief kunnen worden gefilterd via passieve processen. Het helpt bij de klaring van medicijnen, metabolieten, gifstoffen, zware metalen en bepaalde ionen zoals kalium-, waterstof- en ammoniumionen uit het lichaam. Door deze stoffen actief in het filtraat af te scheiden, kunnen de nieren een goede vocht- en elektrolytenbalans handhaven en de pH van lichaamsvloeistoffen reguleren.