Het deel van het lichaam dat wordt aangetast door cryptokokkose is afhankelijk van de vorm van de ziekte.

Pulmonale cryptokokkose: Dit is de meest voorkomende vorm van cryptokokkose en tast de longen aan. Symptomen kunnen zijn:hoesten, koorts, pijn op de borst en kortademigheid.

Meningitis: Dit is een levensbedreigende infectie van de hersenvliezen, de vliezen die de hersenen en het ruggenmerg omringen. Symptomen kunnen zijn:hoofdpijn, koorts, stijve nek, misselijkheid en braken.

Cutane cryptokokkose: Deze vorm van cryptokokkose tast de huid aan. Symptomen kunnen zijn:rode, schilferige plekken op de huid, zweren en knobbeltjes.

Verspreide cryptokokkose: Dit is de ernstigste vorm van cryptokokkose en kan meerdere organen en weefsels in het lichaam aantasten. Symptomen kunnen zijn:koorts, gewichtsverlies, vermoeidheid en verwarring.