De ziekte van Crohn treft ongeveer 0,5% tot 1% van de bevolking in westerse landen, met een iets hogere incidentie in stedelijke gebieden en onder bepaalde etnische groepen. De exacte prevalentie van de ziekte van Crohn varieert per geografische regio, waarbij Noord-Europa en Noord-Amerika de hoogste gerapporteerde cijfers hebben. De incidentie lijkt ook toe te nemen, vooral in de nieuw geïndustrialiseerde landen.