Niet alle ziekten worden veroorzaakt door micro-organismen. Sommige ziekten, zoals genetische aandoeningen, auto-immuunziekten en verwondingen, worden niet veroorzaakt door micro-organismen. Hoewel micro-organismen de oorzaak zijn van veel ziekten die de menselijke gezondheid beïnvloeden. Bacteriën, virussen, schimmels en parasieten kunnen allemaal ziekten bij de mens veroorzaken.