Endogene infecties (ook wel autogene of endogene superinfecties genoemd) worden veroorzaakt door micro-organismen die al in het lichaam van de gastheer aanwezig zijn. Ze onderscheiden zich van exogene infecties, die worden veroorzaakt door micro-organismen die van buitenaf het lichaam binnendringen.

Voorbeelden van endogene infecties zijn onder meer:

* *Urineweginfecties die worden veroorzaakt door bacteriën zoals *Escherichia coli*, die normaal gesproken aanwezig zijn in het maag-darmkanaal.

* *Infecties van huid en weke delen* die worden veroorzaakt door bacteriën die normaal op de huid leven (bijv. Staphylococcus aureus).

* *Opportunistische infecties* die voorkomen bij mensen met een verzwakt immuunsysteem. Deze infecties worden doorgaans veroorzaakt door micro-organismen die deel uitmaken van de normale lichaamsflora, zoals *Candida albicans* of *Aspergillus fumigatus*.

Endogene infecties kunnen gevaarlijk zijn, vooral bij mensen met een verzwakt immuunsysteem of onderliggende medische aandoeningen. Het is belangrijk om endogene infecties vroegtijdig te diagnosticeren en te behandelen om ernstige complicaties te voorkomen.