De overgrote meerderheid van de gevallen van virale myocarditis verdwijnt volledig, met herstel van de normale hartfunctie. De prognose is over het algemeen goed en de meeste mensen herstellen volledig. In zeldzame gevallen kan myocarditis echter leiden tot ernstige complicaties, zoals hartfalen, hartritmestoornissen en plotselinge hartdood. De hersteltijd varieert afhankelijk van de ernst van de infectie en de algehele gezondheid van het individu. Milde myocarditis verdwijnt meestal binnen een paar weken, maar bij ernstigere gevallen kan het enkele maanden of zelfs een jaar duren voordat deze volledig genezen is.