Prokaryoten kunnen een patiënt snel opnieuw infecteren als ze niet worden uitgeroeid omdat ze zich ongeslachtelijk voortplanten. Dit betekent dat ze snel en gemakkelijk kopieën van zichzelf kunnen maken, zonder dat ze een partner hoeven te zoeken. Bovendien zijn prokaryoten erg klein en kunnen ze zich gemakkelijk in het lichaam verbergen, waardoor het moeilijk wordt voor het immuunsysteem om ze allemaal te vinden en te doden.