De eiwitten die vrijkomen door plasmacellen en die antigenen markeren voor vernietiging door fagocyten of complement, worden antilichamen genoemd. Antilichamen zijn gespecialiseerde eiwitten die zich aan specifieke antigenen kunnen binden en helpen deze te neutraliseren of te vernietigen. Wanneer een antigeen in het lichaam wordt geïntroduceerd, produceren plasmacellen antilichamen die specifiek zijn ontworpen om aan dat antigeen te binden. Deze antilichamen kunnen zich vervolgens aan het antigeen binden en het markeren voor vernietiging door fagocyten, dit zijn cellen die vreemde deeltjes opslokken en vernietigen. Bovendien kunnen antilichamen het complementsysteem activeren, een complex netwerk van eiwitten die samenwerken om antigenen te vernietigen.