Botulisme beïnvloedt het zenuwstelsel, met name de neuromusculaire kruispunten waar zenuwen verbinding maken met spieren. Het verstoort de overdracht van signalen van de zenuwen naar de spieren, wat leidt tot spierzwakte en mogelijk verlamming. Dit kan diepgaande gevolgen hebben voor de ademhaling, beweging en andere lichaamsfuncties.