Artsen dompelen thermometers doorgaans niet vóór gebruik in vloeistof. Sommige thermometers, vooral die welke worden gebruikt om de lichaamstemperatuur te meten, kunnen zijn voorzien van een sondehoesje of een wegwerpsondehoesje dat vóór gebruik moet worden verwijderd. Dit helpt de verspreiding van ziektekiemen en infecties te voorkomen. Artsen kunnen ook desinfecterende doekjes of andere methoden gebruiken om de sonde van de thermometer voor en na elk gebruik schoon te maken.