De dunne darm is een gespierde buis bekleed met een slijmvlies. Het slijmvlies bestaat uit verschillende weefsellagen, waaronder:

* Epitheel: Het epitheel is de binnenste laag van het slijmvlies en bestaat uit een enkele laag kolomvormige cellen. Deze cellen zijn verantwoordelijk voor het opnemen van voedingsstoffen uit voedsel en het afscheiden van slijm.

* Lamina propria: De lamina propria is een laag bindweefsel die onder het epitheel ligt. Het bevat bloedvaten, lymfevaten en zenuwen.

* Muscularis mucosae: De masculinis mucosae is een dunne spierlaag die onder de lamina propria ligt. Het helpt voedsel langs de dunne darm te verplaatsen.

* Submucosa: De submucosa is een laag bindweefsel die onder de masculinis mucosae ligt. Het bevat bloedvaten, lymfevaten en zenuwen.

* Muscularis externa: De masculinis externa is de buitenste laag van de dunne darm en bestaat uit twee spierlagen. De binnenste laag bestaat uit cirkelvormige spiervezels, terwijl de buitenste laag bestaat uit longitudinale spiervezels. Deze spieren helpen voedsel langs de dunne darm te verplaatsen.

Naast deze weefsellagen bevat de dunne darm ook een aantal klieren, waaronder de klieren van Brunner en de crypten van Lieberkühn. De klieren van Brunner scheiden slijm af, terwijl de crypten van Lieberkühn spijsverteringsenzymen afscheiden.