Het spijsverteringssap dat alleen op eiwitten inwerkt, is trypsine. Trypsine wordt geproduceerd door de alvleesklier en uitgescheiden in de dunne darm. Het is een endopeptidase, wat betekent dat het peptidebindingen binnenin eiwitmoleculen splitst. Trypsine werkt in op eiwitten die gedeeltelijk zijn afgebroken door andere spijsverteringsenzymen, zoals pepsine uit de maag, en zet deze om in kleinere peptiden en aminozuren.