Het enzym dat de vertering van eiwitten voltooit, is peptidase. Peptidasen zijn een klasse enzymen die eiwitten afbreken tot kleinere peptiden en uiteindelijk tot individuele aminozuren. Ze werken door de peptidebindingen te hydrolyseren die aminozuren in de eiwitketen met elkaar verbinden. Peptidasen worden aangetroffen in het spijsverteringsstelsel van dieren en planten en zijn ook betrokken bij een verscheidenheid aan andere biologische processen, zoals de bloedstolling en de immuunrespons.