Het deel van de cel dat veel enzymen bevat die cellen kunnen verteren en grote moleculen in kleinere kunnen afbreken, is het lysosoom. Lysosomen zijn kleine, zakachtige organellen die worden aangetroffen in het cytoplasma van dierlijke cellen. Ze zijn gevuld met een verscheidenheid aan enzymen, waaronder proteasen, lipasen en nucleasen, die respectievelijk eiwitten, vetten en nucleïnezuren kunnen afbreken. Lysosomen bevatten ook een membraan dat de cel beschermt tegen de spijsverteringsenzymen.

Lysosomen spelen een belangrijke rol in het proces van cellulaire vertering. Wanneer een cel voedsel tot zich neemt, wordt het voedsel eerst door de enzymen in de lysosomen afgebroken tot kleinere moleculen. De resulterende moleculen worden vervolgens door de cel opgenomen en gebruikt voor energie of om nieuwe celstructuren te bouwen. Lysosomen spelen ook een rol in het proces van celdood. Wanneer een cel sterft, scheuren de lysosomen en komen hun spijsverteringsenzymen vrij, die de inhoud van de cel afbreken. Dit proces wordt autolyse genoemd.