Het grootste deel van de eiwitopname vindt plaats in de dunne darm . Nadat eiwitten gedeeltelijk in de maag zijn verteerd en in kleinere peptiden zijn afgebroken, komen ze in de dunne darm terecht, wat de belangrijkste plaats is voor hun opname. De binnenwand van de dunne darm bevat talrijke vingerachtige uitsteeksels, villi genaamd, die het beschikbare oppervlak voor absorptie vergroten. Gespecialiseerde cellen, enterocyten genaamd, die zich op het oppervlak van de villi bevinden, zijn verantwoordelijk voor het absorberen en transporteren van eiwitten via de darmbarrière naar de bloedbaan. Deze enterocyten hebben specifieke transporteiwitten en enzymen die de opname en verwerking van aminozuren, de bouwstenen van eiwitten, vergemakkelijken.