Lactose-intolerantie varieert binnen de Japanse bevolking. Ongeveer 20-30% van de Japanners heeft mogelijk een zekere mate van lactose-intolerantie, hoewel niet iedereen symptomen kan ervaren. De prevalentie is over het algemeen lager dan in sommige westerse populaties, waar deze kan oplopen tot 75%. Genetische variaties, verschillen in lokaal voedsel en aanpassing aan een lagere inname van zuivelproducten door de jaren heen kunnen allemaal een rol spelen in deze variatie.