De dunne darm is semi-permeabel, wat betekent dat sommige stoffen erdoor kunnen, terwijl andere stoffen worden geblokkeerd. Hierdoor kan het lichaam voedingsstoffen opnemen uit het voedsel dat we eten, terwijl wordt voorkomen dat schadelijke stoffen in de bloedbaan terechtkomen. De dunne darm is bekleed met een laag epitheelcellen met kleine poriën die tight kruispunten worden genoemd. Deze nauwe verbindingen laten kleine moleculen, zoals water en glucose, door, terwijl grotere moleculen, zoals eiwitten en vetten, worden geblokkeerd. De dunne darm bevat ook een netwerk van bloedvaten die helpen voedingsstoffen in de bloedbaan op te nemen.