* Serotype: EHEC-stammen behoren tot een specifieke serotypegroep, zoals O157:H7, terwijl normale flora-E.coli-stammen verschillende serotypen hebben.

* Gifstofproductie: EHEC produceert een of meer Shiga-toxinen (Stx1 en/of Stx2), dit zijn krachtige cytotoxinen die verantwoordelijk zijn voor de ernstige symptomen van EHEC-infectie. Normale flora E. coli-stammen produceren geen Shiga-toxines.

* Pathogeniciteit: EHEC-stammen zijn pathogeen en kunnen ernstige ziekten veroorzaken, zoals hemorragische colitis (HC) en hemolytisch-uremisch syndroom (HUS), vooral bij jonge kinderen en ouderen. Normale flora E. coli-stammen zijn over het algemeen onschadelijk of kunnen een gunstige rol spelen in de darmen.

* Kolonisatie: EHEC-stammen hebben specifieke virulentiefactoren waardoor ze zich kunnen hechten aan het darmslijmvlies en deze kunnen koloniseren, waardoor de productie en afgifte van Shiga-toxines wordt vergemakkelijkt. Normale flora E. coli-stammen hebben verschillende kolonisatiemechanismen en veroorzaken geen significante schade aan de gastheer.

* Verzending: EHEC wordt overgedragen door de inname van besmet voedsel of water, of door contact met besmette dieren of individuen. Normale flora E. coli-stammen worden via de omgeving verkregen en maken deel uit van het darmmicrobioom.

Over het geheel genomen verschilt Enterohemorragische E. coli van normale flora E. coli in termen van serotype, toxineproductie, pathogeniteit, kolonisatie en overdracht. Terwijl normale E. coli-stammen in de flora meestal onschadelijk of zelfs gunstig zijn, kunnen EHEC-stammen ernstige ziekten veroorzaken en vereisen ze specifieke voorzorgsmaatregelen om infectie te voorkomen.