Epilepsie kan in elk deel van de hersenen voorkomen. De meest voorkomende delen van de hersenen die door epilepsie worden getroffen, zijn echter:

* De temporale kwabben: Deze bevinden zich aan de zijkanten van de hersenen en zijn verantwoordelijk voor het geheugen, de taal en het gehoor.

* De frontale kwabben: Deze bevinden zich aan de voorkant van de hersenen en zijn verantwoordelijk voor het denken, plannen en oplossen van problemen.

* De pariëtale kwabben: Deze bevinden zich bovenaan de hersenen en zijn verantwoordelijk voor het verwerken van sensorische informatie zoals aanraking, smaak en geur.

* De achterhoofdskwabben: Deze bevinden zich aan de achterkant van de hersenen en zijn verantwoordelijk voor het gezichtsvermogen.

Epilepsie kan ook voorkomen in het cerebellum, dat zich aan de achterkant van de hersenen bevindt en verantwoordelijk is voor coördinatie en evenwicht.