Een gedeeltelijke hysterectomie, waarbij de baarmoeder wordt verwijderd maar de baarmoederhals op zijn plaats blijft, behandelt endometriose niet. Endometriose is een aandoening waarbij endometriumweefsel buiten de baarmoeder groeit. Een totale hysterectomie, waarbij de baarmoeder en de baarmoederhals worden verwijderd, kan een effectieve behandeling zijn voor endometriose, maar geneest niet. Zelfs na een hysterectomie kunnen sommige vrouwen nog steeds symptomen van endometriose ervaren.