Omphalocèle-reparatie wordt doorgaans kort na de geboorte uitgevoerd, meestal binnen de eerste paar dagen van het leven. De exacte timing van de operatie hangt af van verschillende factoren, waaronder de grootte van de omphalocele, de algehele gezondheid van de baby en de aanwezigheid van eventuele andere medische aandoeningen.

In sommige gevallen kan omphalocele-reparatie in fasen worden uitgevoerd. Als de omphalocele bijvoorbeeld erg groot is, kan de chirurg in eerste instantie een silo of gaas over het defect plaatsen om de omvang ervan geleidelijk te verkleinen voordat deze volledig wordt gesloten.

Het doel van omphalocele-reparatie is om de buikinhoud veilig terug te brengen in de buik van de baby en het buikwanddefect te sluiten. De operatie wordt meestal uitgevoerd onder algemene anesthesie en vereist mogelijk het gebruik van speciale chirurgische technieken om de risico's te minimaliseren en een succesvol resultaat te garanderen.