De significante risico's van een maag-bypassoperatie zijn onder meer:

- Bloeden

- Infectie

- Lekkage van maaginhoud in de buik

- Bloedstolsels in de benen of longen

- Hernia

- Voedingstekorten

- Moeilijkheden met slikken

- Dumpingsyndroom, een aandoening die misselijkheid, braken en diarree veroorzaakt na het eten

- Gastro-oesofageale refluxziekte (GORZ)

- Pancreatitis