Flowcytometrie is een techniek die wordt gebruikt om de fysieke kenmerken en chemische inhoud van biologische cellen te analyseren terwijl ze in één bestand door een lichtstraal stromen. De cellen die voor flowcytometrie worden gebruikt, worden gewoonlijk gekleurd met fluorescerende kleurstoffen of antilichamen die zich binden aan specifieke doelen in de cellen. Terwijl de gekleurde cellen door de lichtstraal stromen, zenden ze lichtsignalen uit die worden gedetecteerd en geanalyseerd door de flowcytometer. De gedetecteerde lichtsignalen worden vervolgens gebruikt om de grootte, vorm, granulariteit en andere fysieke kenmerken van de cellen te bepalen, evenals de aanwezigheid en concentratie van specifieke doelmoleculen in de cellen.
Flowcytometrie is een veelzijdige techniek die wordt gebruikt in verschillende gebieden van de biologie, zoals onder meer immunologie, celbiologie en kankeronderzoek. Het maakt een snelle, nauwkeurige en multi-parametrische analyse van grote celpopulaties mogelijk, waardoor waardevolle informatie wordt verkregen over celgedrag en -kenmerken.