Gezwollen lymfeklieren kunnen verschillende graden van pijn veroorzaken, variërend van mild ongemak tot intense pijn. De mate van pijn hangt doorgaans af van de oorzaak en de ernst van de zwelling. Een milde zwelling kan slechts een lichte gevoeligheid veroorzaken, terwijl een grotere zwelling tot ernstige pijn kan leiden.

Gezwollen lymfeklieren als gevolg van een virale infectie zoals verkoudheid kunnen bijvoorbeeld licht ongemak of pijn veroorzaken. Aan de andere kant kunnen gezwollen lymfeklieren als gevolg van een bacteriële infectie, zoals keelontsteking of een huidinfectie, ondraaglijk pijnlijk zijn. De pijn die gepaard gaat met gezwollen lymfeklieren kan in het getroffen gebied worden gevoeld of kan uitstralen naar andere delen van het lichaam.