De overgrote meerderheid van baarmoederhalskanker wordt veroorzaakt door het humaan papillomavirus (HPV), een seksueel overdraagbare infectie. HPV is de meest voorkomende virale infectie van het voortplantingsstelsel en is verantwoordelijk voor bijna alle gevallen van baarmoederhalskanker. Er zijn meer dan 100 verschillende soorten HPV, en sommige hebben een grotere kans kanker te veroorzaken dan andere. HPV 16 en HPV 18 zijn de twee typen die het vaakst geassocieerd worden met baarmoederhalskanker en zijn verantwoordelijk voor ongeveer 70% van alle gevallen. Andere typen HPV die baarmoederhalskanker kunnen veroorzaken zijn HPV 31, HPV 33, HPV 35, HPV 39, HPV 45, HPV 51, HPV 52, HPV 56, HPV 58, HPV 59 en HPV 66.