Het enzym dat in de maag aanwezig is en helpt bij de vertering van eiwitten, wordt pepsine genoemd. Pepsine wordt uitgescheiden in de vorm van pepsinogeen, dat inactief is, en vervolgens in de zure omgeving van de maag wordt geactiveerd door zoutzuur. Pepsine werkt het beste in zure omstandigheden en breekt eiwitten af ​​in kleinere peptidefragmenten, waardoor ze worden voorbereid op verdere vertering door andere enzymen in de dunne darm.