De prognose voor adenocarcinoom van een onbekende primaire (CUP) is over het algemeen slecht, met een vijfjaarsoverleving van ongeveer 5-10%. Dit komt omdat CUP vaak in een vergevorderd stadium wordt gediagnosticeerd, wanneer de kanker zich al naar andere delen van het lichaam heeft verspreid. De prognose voor CUP kan variëren, afhankelijk van het specifieke type adenocarcinoom en het stadium van de ziekte bij diagnose. Sommige soorten adenocarcinoom zijn agressiever dan andere, en hoe eerder de ziekte wordt gediagnosticeerd en behandeld, hoe beter de prognose.