Het organische eiwit dat verantwoordelijk is voor de botmatrix waaraan hydroxyapatiet zich bindt, is collageen. Collageen is het meest voorkomende eiwit in het menselijk lichaam en vormt ongeveer 30% van alle eiwitten. Het is een vezelachtig eiwit dat wordt aangetroffen in botten, pezen, ligamenten, huid en kraakbeen. Collageen geeft kracht en flexibiliteit aan deze weefsels en helpt ze bij elkaar te houden.

In botten zijn collageenvezels gerangschikt in een matrix die een platform vormt voor de afzetting van hydroxyapatiet, een calciumfosfaatmineraal. Hydroxyapatietkristallen worden afgezet op de collageenvezels en vormen een composietmateriaal dat hard en sterk is. Dit mineralisatieproces is essentieel voor de goede ontwikkeling en het onderhoud van botten.

Zonder collageen zouden botten veel zwakker zijn en vatbaarder voor breuken. Collageen helpt ook om de botdichtheid en flexibiliteit te behouden. Naarmate mensen ouder worden, verliezen ze collageen, wat kan leiden tot osteoporose, een aandoening die wordt gekenmerkt door zwakke en broze botten.