Scrubs zijn er in verschillende kleuren, maar de meest voorkomende kleuren zijn blauw, groen en wit. Andere populaire kleuren zijn roze, lavendel en geel. De kleur van een scrubtop of -broek wordt meestal gekozen op basis van de persoonlijke voorkeur van de drager of de dresscode van de zorginstelling waar hij of zij werkt. Scrubs-kleuren worden vaak gekozen omdat ze praktisch en professioneel zijn. Donkere kleuren zoals marineblauw en zwart hebben bijvoorbeeld de neiging om vuil en vlekken beter te verbergen, terwijl lichte kleuren zoals wit en lichtblauw meer licht reflecteren en de drager koel kunnen houden in warme omgevingen. Sommige ziekenhuizen en zorginstellingen hebben ook specifieke kleurcoderingssystemen voor verschillende afdelingen of functies, zoals het gebruik van groene scrubs voor chirurgen of blauwe scrubs voor verpleegkundigen.