De verwijdering van biologisch gevaarlijk afval volgt de regelgeving en mag niet op de reguliere manier worden weggegooid. Dit afval vereist speciale inzamelingsprocedures, scheiding, behandeling, opslag en transport. Om op de juiste manier met biologisch gevaarlijk afval om te gaan, moet het:

1. Op het moment van productie gescheiden in geschikte containers met labels voor biologisch gevaar.

2. Opgeslagen in lekvrije, gesloten containers in aangewezen veilige en beveiligde gebieden met beperkte toegang.

3. Behandeld om het niet-infectieus te maken via goedgekeurde methoden zoals autoclaveren, magnetronen, chemische desinfectie, enz. (voor laboratoria die geen interne behandelingsfaciliteiten hebben; deze processen hebben strikte voorwaarden)

4. Alleen getransporteerd door erkende bedrijven voor de verwijdering van biologisch gevaarlijk afval die zorgen voor adequate verpakking, etikettering en noodapparatuur om te kunnen omgaan met onvoorziene omstandigheden tijdens het transport.

5. Verwijderd naar erkende stortplaatsen voor medisch afval of verbrandingsovens die zich strikt houden aan de milieuvoorschriften.

Onjuiste of illegale verwijdering van biologisch gevaarlijk afval kan ernstige risico's met zich meebrengen voor beroepsbeoefenaren in de gezondheidszorg, afvalverwerkers, het milieu en het grote publiek vanwege hun potentiële vermogen om schadelijke micro-organismen en infectieziekten over te dragen.