De belangrijkste oorzaak van het instorten van de caldera is het leeglopen van een magmakamer onder het aardoppervlak. Wanneer magma uit een magmakamer wordt verwijderd, kan het bovenliggende gesteente niet langer worden ondersteund en stort het in, waardoor een caldera ontstaat. Dit proces kan worden veroorzaakt door een aantal gebeurtenissen, waaronder vulkaanuitbarstingen, aardbevingen en veranderingen in de structuur van de aardkorst.

Tijdens een vulkaanuitbarsting stijgt magma uit de magmakamer naar de oppervlakte. Hierdoor kan de magmakamer leeglopen en kan het bovenliggende gesteente instorten, waardoor een caldera ontstaat. Aardbevingen kunnen ook het instorten van de caldera veroorzaken, omdat ze ervoor kunnen zorgen dat het gesteente rond de magmakamer verzwakt en onstabiel wordt. Ten slotte kunnen veranderingen in de aardkorst, zoals de beweging van tektonische platen, er ook voor zorgen dat de caldera instort.